MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 15000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	CCTC	2	8	72	79	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017912	CTTA	2	8	103	110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017912	TGC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017912	ACA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017912	CAA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017912	ATATT	2	10	418	427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017912	CA	3	6	503	508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017912	TTG	2	6	520	525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017912	CTA	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017912	GT	3	6	590	595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017912	T	7	7	620	626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017912	AGG	2	6	667	672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017912	CTA	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017912	TAC	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017912	AT	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017912	ATTAT	2	10	2184	2193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017912	AGG	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017912	TGC	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017912	TCA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017912	T	6	6	3434	3439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017912	AT	3	6	5105	5110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017912	T	6	6	7096	7101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017912	CTA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017912	ATT	2	6	7242	7247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017912	T	7	7	7269	7275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017912	TAT	2	6	9769	9774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017912	A	7	7	9786	9792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017912	GAT	2	6	9808	9813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017912	TGT	2	6	9831	9836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017912	A	7	7	9875	9881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017912	GA	3	6	9928	9933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017912	CAA	2	6	9936	9941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017912	TAAA	2	8	9992	9999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017912	AGTC	2	8	10018	10025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017912	ACT	2	6	10028	10033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017912	GGC	2	6	10071	10076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017912	GCG	2	6	10131	10136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017912	CCTG	2	8	10161	10168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017912	GCA	2	6	10390	10395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017912	CGC	2	6	10437	10442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017912	GTGA	2	8	10443	10450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017912	TGT	2	6	10476	10481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017912	GAA	2	6	10486	10491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017912	GGC	2	6	10510	10515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017912	CAG	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017912	ATT	2	6	10600	10605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017912	AGA	2	6	10700	10705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017912	GGA	2	6	10750	10755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017912	CT	3	6	10775	10780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017912	GAG	2	6	10798	10803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017912	TGC	2	6	10895	10900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017912	GAA	2	6	11014	11019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017912	GGT	2	6	11088	11093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017912	GTC	2	6	11102	11107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017912	TCGTG	2	10	11111	11120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017912	GGA	2	6	11214	11219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017912	ATC	2	6	11238	11243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017912	AC	3	6	11265	11270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017912	AC	3	6	11434	11439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017912	CAC	2	6	11449	11454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017912	AGCC	2	8	11497	11504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017912	GAT	2	6	11520	11525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017912	CCT	2	6	11576	11581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017912	CATTC	2	10	11660	11669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017912	TGT	2	6	11677	11682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017912	GGACG	2	10	11812	11821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017912	AAGC	2	8	11848	11855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017912	CAC	2	6	11887	11892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017912	GGA	2	6	11972	11977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017912	GCG	2	6	12006	12011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017912	AGG	2	6	12124	12129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017912	TC	3	6	12156	12161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017912	CGG	2	6	12180	12185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017912	GGA	2	6	12212	12217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017912	AGT	2	6	12333	12338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017912	AGA	2	6	12414	12419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017912	CACG	2	8	12544	12551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017912	TC	3	6	12617	12622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017912	AGC	2	6	12875	12880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017912	TTC	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017912	ACC	2	6	13201	13206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017912	G	6	6	13226	13231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017912	AGG	2	6	13236	13241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017912	GCGA	2	8	13332	13339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017912	TAG	2	6	13344	13349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017912	GAG	2	6	13431	13436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017912	GA	3	6	13454	13459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017912	GA	3	6	13533	13538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017912	CGG	2	6	13691	13696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017912	GA	3	6	13789	13794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017912	TAGG	2	8	13907	13914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017912	TAC	2	6	13961	13966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017912	CGC	2	6	13991	13996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017912	CGGG	2	8	14003	14010	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017912	CCT	2	6	14049	14054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017912	GGT	2	6	14185	14190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017912	CGT	2	6	14380	14385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017912	GAG	2	6	14429	14434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017912	GTT	2	6	14483	14488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017912	C	6	6	14556	14561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017912	GAT	2	6	14607	14612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017912	ATCG	2	8	14668	14675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017912	GA	3	6	14720	14725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017912	TGG	2	6	14741	14746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017912	CGC	2	6	14844	14849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017912	T	6	6	14891	14896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017912	CCTTT	2	10	15864	15873	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017912	ATA	2	6	15937	15942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017912	A	6	6	17448	17453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017912	T	8	8	17482	17489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017912	TGT	2	6	17515	17520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017912	TTTGAA	2	12	17523	17534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017912	AAGA	2	8	18926	18933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017912	TGA	2	6	18938	18943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017912	A	6	6	18973	18978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017912	ATT	2	6	18983	18988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017912	A	7	7	18992	18998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017912	ATCT	2	8	19003	19010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017912	CT	3	6	20698	20703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017912	AG	3	6	20709	20714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017912	GTG	2	6	20722	20727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017912	T	6	6	20895	20900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017912	GTT	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017912	ATA	2	6	23482	23487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017912	GAAAT	2	10	23511	23520	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017912	A	6	6	23521	23526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017912	TAT	2	6	23566	23571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017912	GGA	2	6	23585	23590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017912	TCC	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017912	AT	3	6	23708	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017912	T	6	6	23751	23756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017912	A	7	7	23763	23769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017912	TCC	2	6	25088	25093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017912	TA	3	6	25126	25131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017912	A	6	6	25160	25165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017912	TA	3	6	26458	26463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017912	TGAA	2	8	26468	26475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017912	CCT	2	6	26481	26486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017912	A	6	6	26511	26516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017912	CTG	2	6	27100	27105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017912	A	6	6	27138	27143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017912	AAG	2	6	27147	27152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017912	AG	3	6	27151	27156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017912	TG	3	6	27685	27690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017912	CAT	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017912	ATTT	2	8	27723	27730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017912	TAAG	2	8	27829	27836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017912	GGAA	2	8	27891	27898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017912	GCA	2	6	27899	27904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_017912	AG	3	6	29832	29837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017912	ATAA	2	8	30175	30182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017912	A	6	6	31530	31535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017912	TAAA	2	8	31558	31565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017912	GGA	2	6	32780	32785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017912	AC	3	6	33000	33005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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439	NC_017912	CGG	2	6	96347	96352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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